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一鍵啟動——數(shù)字PCR實驗

一鍵啟動——數(shù)字PCR實驗
貝克曼庫爾特生命科學(xué)  2024-06-27  |  閱讀:1111

數(shù)字PCR(Digital PCR,dPCR)是一種核酸分子絕對定量技術(shù),它通過直接計數(shù)DNA分子的個數(shù)來實現(xiàn)對起始樣品的絕對定量。


作為基于微流控的新一代PCR技術(shù),這三點優(yōu)勢讓它能在一眾PCR檢測手段中突出重圍。


絕對定量:

數(shù)字PCR能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),實現(xiàn)對起始樣品的絕對定量,避免了傳統(tǒng)定量PCR中相對定量的局限性。


高靈敏度:

數(shù)字PCR能夠檢測出低頻率的突變和表達變化,提高了檢測的靈敏度和準確性。


可靠性:

數(shù)字PCR采用統(tǒng)計學(xué)原理進行數(shù)據(jù)分析,能夠降低實驗誤差和假陽性率,提高結(jié)果的可靠性。


從實驗流程上看,數(shù)字PCR檢測可分為以下四個步驟:


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圖一:數(shù)字PCR檢測標準流程展示


隨著檢測通量以及實驗樣本處理方式的復(fù)雜度持續(xù)升級,體系制備成為了讓科學(xué)家們頭疼的難題,主要體現(xiàn)在體系配置工作量大,手工重復(fù)性差,前處理耗時長等。


為幫助科學(xué)家們在體系配置上的難題,小貝為科學(xué)家們推薦一款輔助工具——Biomek i系列自動化移液工作站。


自動化ddPCR(微滴式數(shù)字PCR)體系配置


高通量處理:

自動化ddPCR系統(tǒng)能夠一次性處理大量樣本,大大提高了實驗通量,減少了人工操作的時間和誤差。


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圖二:以多重數(shù)字PCR檢測重組腺相關(guān)病毒(rAAV)病毒基因組拷貝數(shù)實驗流程為例,1小時可完成6*96個待測樣本的體系配置。


降低人工成本:

自動化ddPCR系統(tǒng)可以減少對專業(yè)操作人員的依賴,降低人工成本。


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圖三:自動化軟件dPCR全流程自動化程序展示。標準化實驗流程,全自動化完成,無需人員進行實驗操作


結(jié)果保障:

可重復(fù)性,精確度高,穩(wěn)定的結(jié)果輸出。


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圖四:圖A為自動化標準品梯度稀釋試驗,結(jié)果表明定量限可低至 20 拷貝/反應(yīng),檢測限可至 5~10 拷貝/反應(yīng),ddPCR 方法能更好的用于標準品的定量和殘留檢測。


圖B為 AAV 基因組滴度檢測的代表性圖譜,通過對 自動化AAV 樣品的前處理,再通過 ddPCR 系統(tǒng)進行液滴生成并進行 PCR 擴增后讀取液滴信號,結(jié)果表明使用 ddPCR 對病毒滴度進行檢測,其結(jié)果陰陽性區(qū)分明顯,易于分析,結(jié)果準確,并且相同樣品不同天檢測 CV 值 ≤10%。


未來數(shù)字PCR可拓展的應(yīng)用領(lǐng)域:


精準醫(yī)學(xué):

數(shù)字PCR在精準醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用將進一步拓展,包括基因表達差異研究、拷貝數(shù)變異(CNV)研究、腫瘤治療的伴隨診斷等。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以實現(xiàn)對基因表達的精確定量,為疾病的診斷和治療提供有力支持。


環(huán)境監(jiān)測:

隨著全球?qū)ι锇踩铜h(huán)境保護的重視,數(shù)字PCR在環(huán)境監(jiān)測領(lǐng)域的應(yīng)用也將逐漸增多。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以檢測和監(jiān)測環(huán)境中的致病微生物和污染物,為環(huán)境保護和公共衛(wèi)生安全提供重要保障。


農(nóng)業(yè)遺傳改良:

在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,數(shù)字PCR技術(shù)可以用于農(nóng)作物基因變異的檢測和分析,為育種工作提供有力支持。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以更加精確地檢測和分析農(nóng)作物中的基因變異,為培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病的農(nóng)作物品種提供技術(shù)支持。


貝克曼庫爾特生命科學(xué)提供專業(yè)的軟件硬件支持,以及客戶應(yīng)用開發(fā)來滿足大家對于生命科學(xué)自動化的需求。


關(guān)于貝克曼自動化整合部門介紹:

1 貝克曼庫爾特生命科學(xué)自動化整合部門位于美國Indianapolis,該部門位于Beckman質(zhì)量管理系統(tǒng)下,并經(jīng)過ISO9001認證,部門配備整合實驗室,完成整合設(shè)備的研發(fā)。


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2 整合部門人員包含機械、電子、軟件、系統(tǒng)工程師,和工程師支持、項目管理人員。人員配備齊全,售前售后響應(yīng)快速。


3 如有特殊功能開發(fā),Beckman團隊可協(xié)助客戶在國內(nèi)進行軟硬件開發(fā)和測試。

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