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系統(tǒng)配置:
■ Illumina Hiseq 2500基因測(cè)序分析系統(tǒng)
這臺(tái)儀器狀況良好,已經(jīng)在SpectraLab Scientific進(jìn)行了測(cè)試。
所有套件和組件均包含90天保修。
技術(shù)參數(shù):
1、高數(shù)據(jù)通量:每次儀器運(yùn)行讀取高通量模式可在6天內(nèi)生成1T堿基數(shù)據(jù),或用使用快速模塊在27小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生120G堿基數(shù)據(jù)。
2 、實(shí)驗(yàn)時(shí)間:常規(guī)模式下單端讀取2.5天,雙端讀取11天,快速模塊下雙端讀取27個(gè)小時(shí)(根據(jù)測(cè)序長(zhǎng)度略有變化);
3、數(shù)據(jù)讀長(zhǎng):常規(guī)模式單端讀取序列,讀長(zhǎng)大于100個(gè)堿基;快速模式單端讀取序列,讀長(zhǎng)大于150個(gè)堿基
4、雙端讀取序列:常規(guī)模式讀長(zhǎng)大于2x100個(gè)堿基,快速模式讀長(zhǎng)大于2x150個(gè)堿基
5、樣品用量:DNA樣本需要0.1微克
6、讀取精度:原始數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性≥98.5%,3倍覆蓋拼接序列準(zhǔn)確性≥99.99%
7、可精確讀取≥12個(gè)的連續(xù)單個(gè)重復(fù)堿基(如AAAAAAAAAAAA),準(zhǔn)確性≥99%
應(yīng)用范圍:
每次運(yùn)行可選擇高通量(6天1T數(shù)據(jù))或快速(27小時(shí)120G數(shù)據(jù))模塊,可以滿足基因組研究的絕大多數(shù)應(yīng)用。對(duì)DNA,RNA,表觀研究都有配套的方案。具體應(yīng)用:
1、未知物種基因組的從頭測(cè)序
2、已經(jīng)測(cè)序物種的基因組重新測(cè)序
3、基因組尺度轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析(Transcriptomics)
4、基因表達(dá)譜及基因調(diào)控研究
5、全基因組小分子RNA(miRNA)分析
6、染色質(zhì)免疫互沉淀研究(ChIP)
7、多重單核苷酸多型性(SNP)分析
8、甲基化研究
9、其他表觀遺傳學(xué)研究如磷酸化修飾
10、蛋白-DNA相互作用研究
11、染色體重排研究(缺失,插入等等)
Spectralab在分析設(shè)備方面擁有專業(yè)知識(shí)。歡迎您與我們的專業(yè)團(tuán)隊(duì)進(jìn)行聯(lián)系,您的任何咨詢我們都會(huì)及時(shí)進(jìn)行回復(fù)。
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暫無數(shù)據(jù)!